Struktura a organizace desetidenního kurzu vipassany ve vězeňském zařízení je v podstatě stejná jako v meditačním centru. Denní rozvrh, meditační instrukce, rozpravy a obecná pravidla chování pro účastníky jsou v zásadě totožné. Tak jako v případě ostatních kurzů této tradice neplatí účastníci ani vězeňské zařízení za kurz žádné poplatky. Správa věznice musí pouze poskytnout jídlo a ubytování pro vězně (což je stejně jejich povinností) a také pro dobrovolníky vipassany, kteří vedou a zajišťují běh kurzu. Preferuje se vegetariánské menu, nicméně toto dosud nebyl na žádném z kurzů významný problém. Kromě toho je potřeba zajistit meditační halu nebo třídu a ubytování pro účastnící se vězně, které musí být po dobu trvání kurzu oddělené od ostatních vězňů. Bližší informace jsou k dispozici ve formě informačního listu* a instrukcí pro vězeňské kurzy.
Předtím než je možné kurz ve věznici uspořádat, je nutné, aby jeden nebo více zaměstnanců daného zařízení absolvovalo 10denní kurz v jednom ze zavedených meditačních center. Je totiž nezbytné, aby ti, kteří mají ve věznici významnou odpovědnost a jež jsou vězňům, kteří se budou kurzu účastnit, dobře známi, plně chápali smysl kurzu a důležitost dodržování jeho pravidel a řádu.
* dostupné pouze v anglickém jazyce